Río San Juan es un tesoro por descubrir, ofreciendo mucha historia, belleza natural, y la idiosincrasia, generosidad y hospitalidad de sus pobladores, haciéndolo un destino turístico único en Centroamérica. San Carlos es la cabecera departamental y es la puerta de entrada para los visitantes. Cuenta con un aeródromo que la conecta con el aeropuerto de Managua, un malecón, un puerto municipal y muelles con lanchas para visitar los atractivos turísticos. En septiembre de cada año se realiza el torneo internacional de pesca deportiva y el festival de carrozas acuáticas.

El Refugio de Vida Silvestre Los Guatuzos ofrece diversidad de especies, destacándose 385 especies de aves acuáticas que forman la concentración más grande de Nicaragua y Centroamérica. También tiene una gran variedad de otras especies de animales.

El Archipiélago de Solentiname, ubicado en el gran lago de Nicaragua, está compuesto por 36 Islas, entre ellas Mancarrón, La Venada, El Zapote, y San Fernando. En ellas se encuentra arqueología, artistas y artesanos, y gran cantidad de flora y fauna.

El Castillo debe su nombre al monumento histórico Fortaleza de la Inmaculada Concepción de María. Los turistas que visitan la fortaleza pueden explorar su interior, recorrer su museo y disfrutar de su belleza escénica.

La Reserva de Biosfera Indio Maíz es considerada una de las áreas naturales más importantes de Centroamérica debido al valor científico de la alta diversidad de especies vegetales y fauna (tapir, manatí, jaguar, chancho de monte, sahino, etc.) y presencia de restos arqueológicos.

San Juan de Nicaragua, llamado anteriormente Greytown, está ubicado a 200 km de San Carlos sobre el Rio San Juan. Aquí encontramos la antigua draga de vapor donde se intentó construir un canal interoceánico. En San Juan viejo, antiguamente Greytown, encontramos cementerios históricos británicos, masones, norteamericanos, y católicos.